Ассоциация «Совет муниципальных образований Калининградской области» (АМОКО) основана в 1998 году.

Ассоциация является добровольным объединением муниципальных образований Калининградской области, объединившихся для выражения, представления и защиты общих интересов, а также для содействия развитию местного самоуправления на территории региона и организации взаимодействия органов местного самоуправления муниципальных образований Калининградской области.
 
Целями деятельности Ассоциации являются: 
1) взаимодействие и сотрудничество с органами государственной власти Калининградской области, территориальными органами федеральных органов исполнительной власти, органами местного самоуправления муниципальных образований, единым общероссийским объединением муниципальных образований, юридическими и физическими лицами в интересах развития местного самоуправления на территории Калининградской области; 
2) участие в формировании и реализации региональных и межмуниципальных программ комплексного социально-экономического развития территорий муниципальных образований; 
3) содействие осуществлению межмуниципального сотрудничества на территории Калининградской области; 
4) содействия взаимодействию муниципальных образований Калининградской области с муниципальными образованиями других субъектов Российской Федерации, международными организациями межмуниципального сотрудничества с целью изучения и распространения лучших практик в сфере муниципального управления; 
5) осуществление международных контактов и связей по вопросам местного самоуправления; 
6) координация деятельности органов местного самоуправления по эффективному решению вопросов местного значения и реализации отдельных государственных полномочий, переданных органам местного самоуправления и содействует в их решении; 
7) содействие вовлечению граждан в процесс осуществления местного самоуправления на территории Калининградской области; 
8) участие в организации и проведении мероприятий в интересах патриотического и гражданского воспитания молодежи муниципальных образований Калининградской области; 
9) осуществление сбора, изучения и анализа информации (мониторинга) по вопросам организации и осуществления местного самоуправления на территории Калининградской области; 
10) оказание консультационной, правовой и методической помощи органам местного самоуправления по вопросам их деятельности; 
11) содействие в организации дополнительного профессионального образования муниципальных служащих, депутатов представительных органов и выборных должностных лиц местного самоуправления; 
12) участие в установленном законодательством порядке в разработке правовых актов органов государственной власти Российской Федерации, органов государственной власти Калининградской области. 

Взаимодействие между органами государственной власти Калининградской области и Ассоциации осуществляется в соответствии с Законом Калининградской области «О взаимодействии органов государственной власти Калининградской области с ассоциацией «Совет муниципальных образований Калининградской области» от 2 октября 2013 года № 258. 

В настоящее время в Калининградской области 22 муниципальных образования – 10 городских и 12 муниципальных округов. 
Членами Ассоциации являются все муниципальные образования региона. 

Для организации эффективного сотрудничества и взаимодействия Ассоциацией заключены соглашения с: 
- Прокуратурой Калининградской области (бессрочно с 4 июля 2011 года); 
- Калининградским региональным отделением Общероссийской общественной организации «Ассоциация юристов России» (бессрочно с 27 июля 2012 года); 
- Главным управлением МЧС России по Калининградской области (бессрочно с 28 февраля 2013 года); 
- Управлением Роспотребнадзора по Калининградской области (бессрочно с 22 апреля 2013 года); 
- Центром специальной связи и информации Федеральной службы охраны Российской Федерации об информационно-правовом взаимодействии (бессрочно с 17 июня 2015 года); 
- Ассоциацией «Совет муниципальных образований Псковской области» (бессрочно с 3 июля 2018 года);
- Федеральным государственным автономным образовательным учреждением высшего образования «Балтийский федеральный университет имени Иммануила Канта» (на 5 лет с пролонгацией с 18 января 2019 года); 
- Министерством природных ресурсов и экологии Калининградской области (бессрочно с 1 июля 2019 года); 
- Могилевской областной ассоциацией местных Советов депутатов Республики Беларусь (бессрочно с 14 января 2021 года); 
- Союзом «Калининградское областное объединение организаций профсоюзов» (на 3 года с 25 апреля 2023 года); 
- Гродненской областной ассоциацией местных Советов депутатов Республики Беларусь (бессрочно с 14 июня 2023 года); 
- Ассоциацией ТОС Ульяновской области (бессрочно с 28 июля 2023 года). 

Обеспечение деятельности органов управления и контроля Ассоциации осуществляет Исполнительная дирекция. 
Текущее руководство деятельностью дирекции осуществляет – исполнительный директор. Также выполняет функции финансового и правового аналитика. 
Главный специалист – осуществляет функции правового аналитика, аналитика данных и администратора сайта. 
Специалист – осуществляет функции бухгалтера и ведёт кадровое делопроизводство в организации.