Ассоциация «Совет муниципальных образований Калининградской области» (АМОКО) основана в 1998 году.

Ассоциация является добровольным объединением муниципальных образований Калининградской области, объединившихся для представления и защиты общих интересов и достижения целей. Целями деятельности Ассоциации является содействие развитию местного самоуправления на территории Калининградской области и организация взаимодействия органов местного самоуправления с органами государственной власти Калининградской области, территориальными органами федеральных органов исполнительной власти, единым общероссийским объединением муниципальных образований; а также организация межмуниципального сотрудничества на территории Калининградской области и взаимодействия с муниципальными образованиями других субъектов Российской Федерации, международными организациями межмуниципального сотрудничества с целью изучения и распространения лучших практик в сфере муниципального управления.

В настоящее время в Калининградской области 22 муниципальных образования - 10 городских и 12 муниципальных округов.

Членами Ассоциации являются все муниципальные образования региона.

Ассоциация «Совет муниципальных образований Калининградской области» наделена правом законодательной инициативы в Калининградской областной Думе с 2003 года (ст.21 Закон Калининградской области от 18.01.1996 № 30 «О вступлении в действие Устава (Основного Закона) Калининградской области»). Также регионом принят Закон Калининградской области «О взаимодействии органов государственной власти Калининградской области с ассоциацией «Совет муниципальных образований Калининградской области» от 2 октября 2013 года № 258.

Согласно регламента Правительства Калининградской области если законопроект затрагивает вопросы, отнесенные к ведению муниципальных образований ассоциация "Совет муниципальных образований Калининградской области" осуществляет процедуру согласования законопроекта (гл.8 ст.255 Регламента Правительства Калининградской области утв. Постановлением Правительства Калининградской области от 24.06.2011 № 450). Также подлежат согласованию проекты поручений Губернатора если исполнение поручений предусматривается главами муниципальных образований (гл.4 ст.130 Регламента Правительства Калининградской области).
Председатель АМОКО включен во все комиссии и иные совещательные органы Правительства КО на которых рассматриваются вопросы, касающиеся муниципальные образования региона, также является постоянным участником заседаний Правительства КО.
Председатель и (или) представители Правления АМОКО, исполнительной дирекции являются членами межведомственных рабочих групп созданных при Прокуратуре (по вопросам нормотворчества, природоохраны), при Правительстве (по вопросам законотворчества, борьбе с коррупцией), при областной Думе.

Ассоциацией заключены и действуют следующие Соглашения:
- о сотрудничестве с Прокуратурой Калининградской области (04 июля 2011 г.);
- о сотрудничестве и взаимодействии с Калининградским региональным отделением Общероссийской общественной организации «Ассоциация юристов России» (27 июля 2012 г.);
- о взаимодействии с Главным управлением МЧС России по Калининградской области (28 февраля 2013 г.);
- о сотрудничестве с Управлением Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Калининградской области (Роспотребнадзор) (22 апреля 2013 г.);
- об информационно-правовом взаимодействии с Центром специальной связи и информации Федеральной службы охраны РФ (17 июня 2015 г.);
- о сотрудничестве и взаимодействии с Калининградской областной Думой шестого созыва (01 марта 2017 г.);
- о сотрудничестве с ФГУБОУВО «Российская академия народного хозяйства и государственной службы при президенте РФ» (08 июня 2017 г.);
- о сотрудничестве с Ассоциацией «Совет муниципальных образований Псковской области» (03 июля 2018 г.);
- о сотрудничестве с ФГАОУВО «Балтийский федеральный университет имени Иммануила Канта» (18 января 2019 г.);
- о сотрудничестве и взаимодействии с Министерством природных ресурсов и экологии Калининградской области (01 июля 2019 г.);
- о сотрудничестве с Союзом «Калининградское областное объединение организаций профсоюзов» (01 октября 2019 г.);
- о взаимодействии с Управлением Федеральной службы судебных приставов по Калининградской области (04 декабря 2019 г.);
- о сотрудничестве и взаимодействии с Могилёвской областной ассоциацией местных Советов депутатов (Республика Беларусь) (14 января 2021 г.).

Постоянно с 2011 года при Ассоциации функционируют секция глав (представительных органов) и секция глав администраций (исполнительных органов) муниципальных образований.

Обеспечение деятельности органов Ассоциации осуществляет исполнительная дирекция Ассоциации (ст.35 Устава).

Общее руководство деятельностью исполнительной дирекции Ассоциации осуществляет Председатель (ст.66 Устава).

Текущее руководство деятельностью исполнительной дирекции осуществляет - исполнительный директор, также выполняет функции финансового и правового аналитика. 
Главный специалист – осуществляет функции правового аналитика, аналитика данных и администратора сайта. 
Специалист – осуществляет функции бухгалтера и ведёт кадровое делопроизводство в организации.